细胞和组织研究：在病理学中，测量显微镜用于观察和测量细胞的大小、形状、结构变化，以及组织的厚度，这对于疾病诊断和研究至关重要。

疾病诊断：例如在眼科，测量显微镜用于检查角膜、虹膜和视网膜的厚度，帮助诊断和评估某些眼部疾病，如青光眼和角膜病变。

肿瘤研究：在肿瘤学中，测量显微镜用于测量肿瘤细胞的大小、形状和生长模式，有助于评估肿瘤的生长速度和侵袭性。

组织工程和生物材料：在生物医学工程中，测量显微镜用于评估人工组织或生物材料的结构和性能，如细胞生长情况、支架材料的孔隙度等。

移植和手术规划：在移植手术中，测量显微镜可以帮助医生精确测量供体组织的尺寸，以确保移植的成功。

疾病追踪和疗效评估：通过定期测量，可以观察疾病的发展和治疗效果，如在某些皮肤病或神经退行性疾病中。

药物研究：测量显微镜可用于药物筛选，评估药物对细胞或组织的毒性以及药物对结构的影响。

微生物学：在微生物学中，测量显微镜用于测量细菌、病毒等微生物的大小，以及抗生素对微生物生长的影响。

医学教育和培训：作为教学工具，测量显微镜帮助医学生和医生学习和理解微观世界，提高他们的诊断技能。